Los riesgos de cualquier cirugía son:

• Sangrado
• Trombosis de la arteria o de la vena
• Pancreatitis aguda (inflamación del páncreas)
• Fístula pancreática
• Problemas respiratorios
• Ataque cardíaco o accidente cerebrovascular
• Infección o absceso de la herida quirúrgica.

El sistema inmunitario del cuerpo considera al órgano trasplantado como un extraño y por consiguiente lo combate. Por lo tanto, para prevenir el rechazo, los pacientes con trasplante de órgano deben tomar medicamentos (FK 506 y corticosteroides) que inhiben (debilitan) la respuesta inmunitaria del cuerpo. Esto hace que la persona tenga menor capacidad de rechazar el órgano trasplantado pero se reduce tambien la capacidad  de combatir diversas infecciones, por lo tanto  durante  los primeros dias es necesario  buscar un equilibrio para que el paciente y su sistema inmunológico “convivan” con el nuevo órgano  y  que no aparezca el rechazo pero también  es necesario  que mantener un sistema inmune que responda  ante la presencia de infecciones.